Pengepungan Samarkand (1220) terjadi pada tahun 1220 M setelah Genghis Khan, pendiri Kekaisaran Mongol, meluncurkan invasi terhadap Kekaisaran Khwarazm yang diperintah oleh Shah Muhammad II. Mongol telah mengepung kota perbatasan Otrar, tetapi karena kecerobohan pertahanannya, pasukan besar yang dipimpin oleh Genghis dan putranya yang termuda, Tolui, terpisah dari pasukan depan dan bergerak ke selatan, menuju Transoxiana.